No tenés porqué ser un politólogo para opinar.

Cita:- Un Estado/Junta/Emperador, según de que época estemos hablando. En definitiva, una unidad central de donde emanen las decisiones políticas, económicas, etc.

No veo porqué esa es una condición. Si un pueblo tiene centenares de años en un territorio y tienen una organización social tal que les permite funcionar interna y externamente, ¿por qué no tienen derecho a conservar su territorio? Si vamos al caso, para que haya habido una guerra entre indígenas y criollos los indígenas se tienen que haber organizado de alguna forma y su dirección debe haber decidido ir a la guerra (en realidad seguramente no les quedó otra). Con esto me refiero a que en caso de necesidad de dirección alguien siempre aparece. Que la dirección que vos reconozcas como válida sea la de emperador, junta o Estado es otra cosa.

Vos pensá que son contextos completamente diferentes. La concepción de "unidad central de donde emanan las decisiones políticas, económicas, etc." que nombrás hace alusión a sociedades cuyo contexto se basa en el comercio internacional, comunicación entre los diferentes pueblos, intereses encontrados y todo un aparato político que responde a los intereses de ciertas personas (en el imperio los intereses del Emperador, en el Estado los intereses de los poseedores de capital privado). Las comunidades indígenas están muy lejos de esto. Ellos producían para autoabastecerse, vivían en comunidades casi completamente cerradas, estaban afectados directamente por la religión y sus creencias, y no necesitaban una estructura política-económica tal como las nombradas anteriormente ya que su dinámica era diferente. ¿Para qué quieren un presidente o símil si entre los jefes de familia seguramente podían decidir qué hacer y qué no cuando era necesario?

Cita:- Un territorio más o menos delimitado, con un gobierno ejerciendo control real sobre él.

De hecho tenían territorios más o menos delimitados ya que entre los mismos indígenas habían gueras por territorios. El Imperio Inca no nació de la noche a la mañana porque fueron asentándose en tierras liberadas, iban dominando lo que encontraban. Y había un cierto control porque había una organización dedicada para el tema guerras (esto en la mayoría de las tribus).